Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP140Q13342 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP140Q13342 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP140Q13342 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP140Q13342 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP140Q13342 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP140Q13342 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP140Q13342 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP140Q13342 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP140Q13342 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SP140Q13342 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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SP140Q13342 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP140Q13342 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP140Q13342 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP140Q13342 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP140Q13342 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP140Q13342 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP140Q13342 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP140Q13342 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP140Q13342 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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SP140Q13342 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP140Q13342 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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SP140Q13342 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP140Q13342 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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SP140Q13342 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP140Q13342 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP140Q13342 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SP140Q13342 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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SP140Q13342 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SP140Q13342 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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SP140Q13342 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP140Q13342 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP140Q13342 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP140Q13342 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP140Q13342 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP140Q13342 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP140Q13342 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP140Q13342 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP140Q13342 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP140Q13342 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP140Q13342 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP140Q13342 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP140Q13342 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP140Q13342 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP140Q13342 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP140Q13342 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP140Q13342 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP140Q13342 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP140Q13342 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SP140Q13342 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP140Q13342 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP140Q13342 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP140Q13342 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP140Q13342 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SP140Q13342 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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