Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SKP2Q13309 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SKP2Q13309 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SKP2Q13309 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SKP2Q13309 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SKP2Q13309 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SKP2Q13309 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SKP2Q13309 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SKP2Q13309 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SKP2Q13309 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SKP2Q13309 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SKP2Q13309 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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