Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CLN3Q13286 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CLN3Q13286 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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