Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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