Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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