Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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KCNMA1Q12791 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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