Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms