Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms