Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms