Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CHRNEQ04844 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms