Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms