Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms