Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VLDLRP98155 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VLDLRP98155 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms