Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA4P83105 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA4P83105 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA4P83105 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA4P83105 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA4P83105 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA4P83105 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA4P83105 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA4P83105 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA4P83105 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA4P83105 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA4P83105 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA4P83105 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA4P83105 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA4P83105 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTRA4P83105 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTRA4P83105 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTRA4P83105 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTRA4P83105 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTRA4P83105 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTRA4P83105 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTRA4P83105 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms