Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms