Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFM1P61960 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms