Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF3P61204 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF3P61204 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF3P61204 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF3P61204 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF3P61204 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF3P61204 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF3P61204 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF3P61204 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF3P61204 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF3P61204 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF3P61204 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF3P61204 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF3P61204 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF3P61204 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF3P61204 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF3P61204 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF3P61204 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF3P61204 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF3P61204 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF3P61204 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF3P61204 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF3P61204 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF3P61204 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF3P61204 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms