Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms