Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCDC1P59894 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms