Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTBP49356 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTBP49356 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTBP49356 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTBP49356 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTBP49356 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTBP49356 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTBP49356 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTBP49356 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTBP49356 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTBP49356 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNTBP49356 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNTBP49356 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNTBP49356 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNTBP49356 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms