Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLMP48507 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLMP48507 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLMP48507 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLMP48507 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLMP48507 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLMP48507 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLMP48507 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLMP48507 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLMP48507 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLMP48507 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLMP48507 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLMP48507 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLMP48507 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLMP48507 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLMP48507 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLMP48507 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLMP48507 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLMP48507 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLMP48507 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLMP48507 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLMP48507 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLMP48507 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLMP48507 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms