Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLCP48506 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GCLCP48506 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms