Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RANGAP1P46060 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RANGAP1P46060 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms