Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGCXP38435 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGCXP38435 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGCXP38435 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGCXP38435 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGCXP38435 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGCXP38435 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGCXP38435 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGCXP38435 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGCXP38435 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGCXP38435 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGCXP38435 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GGCXP38435 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GGCXP38435 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GGCXP38435 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GGCXP38435 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GGCXP38435 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms