Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZEB1P37275 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms