Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms