Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJA4P35212 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA4P35212 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms