Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms