Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms