Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTKP29376 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTKP29376 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTKP29376 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTKP29376 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTKP29376 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LTKP29376 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTKP29376 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTKP29376 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTKP29376 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTKP29376 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTKP29376 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTKP29376 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTKP29376 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTKP29376 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTKP29376 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTKP29376 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LTKP29376 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTKP29376 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTKP29376 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTKP29376 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTKP29376 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTKP29376 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LTKP29376 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTKP29376 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTKP29376 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTKP29376 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTKP29376 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTKP29376 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LTKP29376 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LTKP29376 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTKP29376 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTKP29376 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTKP29376 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTKP29376 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTKP29376 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTKP29376 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LTKP29376 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTKP29376 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTKP29376 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTKP29376 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LTKP29376 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LTKP29376 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTKP29376 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LTKP29376 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTKP29376 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTKP29376 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTKP29376 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LTKP29376 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTKP29376 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTKP29376 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTKP29376 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LTKP29376 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTKP29376 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTKP29376 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTKP29376 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTKP29376 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTKP29376 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTKP29376 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTKP29376 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTKP29376 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTKP29376 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTKP29376 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTKP29376 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTKP29376 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTKP29376 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTKP29376 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LTKP29376 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTKP29376 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTKP29376 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTKP29376 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTKP29376 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LTKP29376 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms