Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms