Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms