Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms