Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms