Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms