Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DMDP11532 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DMDP11532 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DMDP11532 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DMDP11532 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DMDP11532 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DMDP11532 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DMDP11532 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DMDP11532 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
DMDP11532 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
DMDP11532 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DMDP11532 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DMDP11532 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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