Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms