Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APODP05090 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APODP05090 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APODP05090 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APODP05090 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APODP05090 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APODP05090 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APODP05090 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APODP05090 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APODP05090 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APODP05090 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APODP05090 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APODP05090 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APODP05090 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APODP05090 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APODP05090 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APODP05090 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APODP05090 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APODP05090 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APODP05090 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APODP05090 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APODP05090 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APODP05090 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APODP05090 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APODP05090 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APODP05090 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APODP05090 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APODP05090 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APODP05090 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APODP05090 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APODP05090 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APODP05090 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APODP05090 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APODP05090 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APODP05090 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APODP05090 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APODP05090 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APODP05090 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APODP05090 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APODP05090 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APODP05090 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APODP05090 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APODP05090 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APODP05090 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APODP05090 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APODP05090 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APODP05090 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APODP05090 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APODP05090 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APODP05090 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APODP05090 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APODP05090 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APODP05090 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms