Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRP01130 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRP01130 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRP01130 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRP01130 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRP01130 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRP01130 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRP01130 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRP01130 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRP01130 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRP01130 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRP01130 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRP01130 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRP01130 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRP01130 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRP01130 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRP01130 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRP01130 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRP01130 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRP01130 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRP01130 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRP01130 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRP01130 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRP01130 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRP01130 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRP01130 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRP01130 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRP01130 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDLRP01130 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDLRP01130 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDLRP01130 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDLRP01130 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDLRP01130 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDLRP01130 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDLRP01130 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDLRP01130 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDLRP01130 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDLRP01130 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDLRP01130 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRP01130 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRP01130 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRP01130 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRP01130 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRP01130 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRP01130 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRP01130 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRP01130 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRP01130 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRP01130 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRP01130 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRP01130 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRP01130 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRP01130 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRP01130 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRP01130 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRP01130 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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