Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.4 ms