Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYNGR3O43761 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms