Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DENRO43583 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DENRO43583 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DENRO43583 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DENRO43583 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DENRO43583 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DENRO43583 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DENRO43583 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DENRO43583 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DENRO43583 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DENRO43583 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DENRO43583 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DENRO43583 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DENRO43583 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DENRO43583 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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