Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMC8O43402 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMC8O43402 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EMC8O43402 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EMC8O43402 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EMC8O43402 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EMC8O43402 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EMC8O43402 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EMC8O43402 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EMC8O43402 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EMC8O43402 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EMC8O43402 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms