Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms