Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms