Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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