Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms