Protein–RNA interactions for Protein: C9JLR9

C11orf95, Uncharacterized protein C11orf95, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf95C9JLR9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf95C9JLR9 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms