Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms