Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CLDN25C9JDP6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CLDN25C9JDP6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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